Teknologi prototipe menyusut AI untuk menghadirkan fungsionalitas seperti otak dalam satu perangkat yang kuat - ScienceDaily
Offbeat

Realitas virtual interaktif muncul sebagai alat baru untuk desain obat melawan COVID-19 – ScienceDaily


Ilmuwan Bristol telah menunjukkan realitas virtual baru [VR] teknik yang akan membantu dalam mengembangkan obat melawan virus SARS-CoV-2 – dan memungkinkan para peneliti untuk berbagi model dan berkolaborasi dengan cara baru. Alat inovatif, dibuat oleh para peneliti Universitas Bristol, dan diterbitkan di Jurnal Informasi dan Pemodelan Kimia, akan membantu para ilmuwan di seluruh dunia mengidentifikasi arahan obat anti-virus dengan lebih cepat.

Enzim SARS-CoV-2 yang dikenal sebagai protease utama (Mpro) adalah target yang menjanjikan dalam pencarian pengobatan anti-virus baru. Molekul yang menghentikan kerja protease utama – yang disebut inhibitor enzim – menghentikan reproduksi virus, sehingga bisa menjadi obat yang efektif. Para peneliti di seluruh dunia sedang bekerja untuk menemukan molekul semacam itu. Prediktor utama keefektifan obat adalah seberapa erat ikatannya dengan targetnya; mengetahui bagaimana obat cocok dengan protein membantu para peneliti merancang perubahan pada strukturnya untuk membuatnya mengikat lebih erat.

Profesor Adrian Mulholland dari Bristol’s School of Chemistry dan penulis utama studi tersebut menjelaskan: “Kami telah menunjukkan bahwa realitas virtual interaktif dapat memodelkan bagaimana protein dan inhibitor virus mengikat enzim. Peneliti dapat menggunakan alat ini untuk membantu memahami cara kerja enzim, dan juga untuk melihat bagaimana obat potensial masuk ke dalam enzim. Ini akan membantu merancang dan menguji petunjuk obat potensial baru. Kami membagikan model ini dengan seluruh komunitas. “

Tim Bristol telah mengembangkan kerangka kerja virtual untuk simulasi ‘dinamika molekuler’ interaktif. Ini adalah kerangka perangkat lunak sumber terbuka, yang disebut Narupa, yang menggunakan peralatan VR yang sudah tersedia.

Dalam studi ini, tim Bristol membuat struktur model 3D SARS-CoV-2 Mpro dan menggunakan simulasi dinamika molekuler interaktif di VR (iMD-VR) untuk ‘melangkah ke dalamnya’ dan memvisualisasikan molekul yang mengikat enzim, secara detail atom. . Hasil penelitian menunjukkan bahwa pengguna dapat menunjukkan bagaimana molekul obat sesuai dengan enzim.

Profesor Mulholland menambahkan: “Saat ini ada banyak upaya secara global yang bertujuan untuk mengidentifikasi petunjuk obat untuk COVID-19. Alat iMD-VR kami akan menjadi sumber daya yang berharga, memungkinkan kolaborasi virtual untuk komunitas penemuan obat internasional, membantu memprediksi bagaimana lead obat potensial mengikat. untuk target SARS-CoV-2. Aspek yang menarik adalah bahwa hal itu juga memungkinkan peneliti untuk berkolaborasi dengan cara baru: menggunakan komputasi awan, mereka dapat menangani masalah penemuan obat bersama-sama pada saat yang sama ketika mereka berada di lokasi yang berbeda – bahkan berpotensi di negara yang berbeda – bekerja secara bersamaan di lingkungan molekuler virtual yang sama. “

“Pemodelan komputasi tentang bagaimana obat-obatan terikat pada lonjakan protein SARS-CoV-2 sangat penting dalam memajukan perang global melawan pandemi. Narupa membawa pemodelan itu ke tingkat yang sama sekali baru dengan simulasi dinamika molekuler dalam realitas virtual,” kata Alison Derbenwick Miller , Wakil Presiden, Oracle untuk Riset. “Kami senang bahwa infrastruktur cloud berkinerja tinggi Oracle mendukung pengembangan kerangka kerja inovatif ini, dan sekarang membantu memajukan upaya yang terhubung secara global untuk mengalahkan COVID-19. Menumbuhkan komunitas peneliti yang didukung cloud adalah persis seperti yang Oracle for Research. dirancang untuk dilakukan. “

Studi ini didukung oleh dana dari EPSRC, Royal Society dan British Society for Antimicrobial Chemotherapy. Kredit cloud diberikan oleh Oracle for Research.

Sumber Cerita:

Materi disediakan oleh Universitas Bristol. Catatan: Konten dapat diedit untuk gaya dan panjangnya.

Dipersembahkan Oleh : Lapak Judi

Baca Juga : Hongkong Prize