Memajukan pengeditan gen dengan varian CRISPR / Cas9 baru - ScienceDaily
Lingkungan

Identifikasi cepat dan sensitif dari kuman yang kebal terhadap beberapa obat – ScienceDaily


Para peneliti dari University of Basel telah mengembangkan sistem pengujian sensitif yang memungkinkan deteksi resistensi bakteri secara cepat dan andal. Sistem ini didasarkan pada kantilever kecil yang berfungsi, yang bengkok karena pengikatan bahan sampel. Dalam analisis, sistem mampu mendeteksi resistensi dalam jumlah sampel yang setara dengan 1-10 bakteri.

Bakteri yang tidak lagi rentan terhadap berbagai antibiotik menjadi ancaman yang signifikan bagi kesehatan kita. Apabila terjadi infeksi bakteri, dokter memerlukan informasi yang cepat tentang potensi resistensi agar dapat merespon dengan cepat dan tepat.

Sistem kantilever sebagai alternatif Metode tradisional untuk mendeteksi resistensi didasarkan pada pembudidayaan bakteri dan pengujian kepekaannya terhadap spektrum antibiotik. Metode ini membutuhkan waktu 48 hingga 72 jam untuk memberikan hasil, dan beberapa jenis bakteri sulit dibudidayakan. Tes biologi molekuler jauh lebih cepat dan bekerja dengan memperkuat gen resistensi atau urutan pendek spesifik dari bahan genetik dengan polymerase chain reaction (PCR), tetapi bahkan metode ini tidak memberikan hasil yang memuaskan untuk setiap bakteri.

Alternatif datang dalam bentuk metode yang menggunakan kantilever kecil, yang membengkok ketika molekul RNA terikat ke permukaannya, misalnya – dan tekukan ini kemudian dapat dideteksi. Molekul RNA adalah “transkrip” gen dan dapat digunakan sebagai instruksi untuk membangun protein. Selain itu, molekul RNA dapat digunakan untuk mendeteksi gen resistensi pada materi genetik bakteri.

Tidak perlu pelabelan atau amplifikasi

Menulis di jurnal Tantangan Global, tim ilmuwan dari Departemen Fisika, Departemen Biomedik dan Swiss Nanoscience Institute (SNI) di Universitas Basel kini telah mempresentasikan sistem pengujian kantilever yang memungkinkan mereka mendeteksi RNA dari satu bakteri resisten antibiotik. Dengan sistem kantilever baru, sampel tidak perlu diperkuat atau diberi label untuk dianalisis.

Para peneliti mulai dengan melampirkan urutan tiga gen yang terkait dengan resistensi vankomisin ke kantilever dan kemudian mengekspos kantilever yang disiapkan ini ke aliran RNA yang diekstraksi dari bakteri. Jika molekul RNA dari gen resistensi ada, fragmen RNA yang cocok akan mengikat ke kantilever, menyebabkan mereka mengalami defleksi skala nano yang dapat dideteksi menggunakan laser.

Sinyal yang jelas bahkan dengan mutasi titik Metode ini memungkinkan deteksi tidak hanya gen resisten, tetapi juga mutasi titik individu yang terkait dengannya. Untuk mempelajari ini, para peneliti menggunakan mutasi titik yang digabungkan dengan gen yang bertanggung jawab untuk resistensi terhadap ampisilin dan antibiotik betalaktam lainnya.

“Keuntungan besar dari metode yang kami kembangkan adalah kecepatan dan kepekaannya,” kata Dr. François Huber, penulis pertama makalah ini. “Kami berhasil mendeteksi sejumlah kecil fragmen RNA tertentu dalam lima menit.” Dalam kasus mutasi tunggal, jumlah RNA yang terdeteksi sesuai dengan sekitar 10 bakteri. Ketika datang untuk mendeteksi seluruh gen resistensi, para peneliti memperoleh sinyal yang jelas bahkan dengan sejumlah RNA yang berhubungan dengan satu bakteri.

“Jika kita dapat mendeteksi gen atau mutasi spesifik pada genom bakteri, maka kita tahu resistensi antibiotik apa yang akan ditunjukkan bakteri tersebut,” jelas Profesor Adrian Egli dari University Hospital Basel, yang timnya memainkan peran penting dalam penelitian tersebut. “Pekerjaan kami di rumah sakit akan mendapatkan keuntungan dari jenis informasi yang andal dan sensitif tentang resistensi patogen.”

Sumber Cerita:

Materi disediakan oleh Institut Nanosains Swiss, Universitas Basel. Catatan: Konten dapat diedit gaya dan panjangnya.

Dipersembahkan Oleh : Lapak Judi

Baca Juga : Pengeluaran SGP