Teknologi prototipe menyusut AI untuk menghadirkan fungsionalitas seperti otak dalam satu perangkat yang kuat - ScienceDaily
Teknologi

DNA dari sampel air dapat secara akurat menentukan kelimpahan dan biomassa ikan – ScienceDaily


Organisme mengeluarkan DNA di sekitarnya melalui sisa metabolisme, sel kulit yang terkelupas atau gamet, dan materi genetik ini disebut sebagai DNA lingkungan (eDNA).

Karena eDNA dapat dikumpulkan langsung dari air, tanah atau udara, dan dianalisis menggunakan alat molekuler tanpa perlu menangkap organisme itu sendiri, informasi genetik ini dapat digunakan untuk melaporkan keanekaragaman hayati secara massal. Misalnya, keberadaan banyak spesies ikan dapat diidentifikasi secara bersamaan dengan pengambilan sampel dan sekuensing eDNA dari air, sambil menghindari metode penangkapan yang berbahaya, seperti jaring, perangkap atau electrofishing, yang saat ini digunakan untuk pemantauan ikan.

Meskipun pendekatan eDNA telah diterapkan dalam sejumlah studi tentang keanekaragaman ikan di berbagai jenis habitat akuatik: sungai, danau, dan sistem laut, efisiensinya dalam mengukur kelimpahan spesies (jumlah individu per spesies) masih harus ditentukan. Meskipun penelitian sebelumnya, yang dilakukan dalam sistem perairan terkontrol, seperti akuarium, tangki percobaan, dan kolam buatan, telah melaporkan korelasi positif antara jumlah DNA yang ditemukan di air dan kelimpahan spesies, masih belum jelas bagaimana hasilnya di lingkungan alami.

Namun, tim peneliti dari University of Hull bersama dengan Badan Lingkungan (Inggris), mengambil kesempatan langka untuk menggunakan program pemberantasan spesies invasif yang dilakukan di sebuah peternakan perikanan Inggris sebagai studi kasus akhir untuk mengevaluasi tingkat keberhasilan eDNA. pengambilan sampel dalam mengidentifikasi kelimpahan spesies di habitat perairan alami. Temuan mereka dipublikasikan di jurnal peer-review akses terbuka Metabarcoding dan Metagenomics.

“Menyelidiki kekuatan kuantitatif eDNA di habitat akuatik alami itu sulit, karena tidak ada cara untuk memastikan kelimpahan spesies nyata dan biomassa (berat) dalam sistem akuatik, kecuali jika semua organisme target keluar dari air dan menghitung / mengukur semuanya,” jelas Cristina Di Muri, mahasiswa PhD di University of Hull.

Selama pemberantasan, kolam ikan asli dikeringkan dan semua ikan, kecuali spesies invasif yang bermasalah: gudgeon topmouth, ditempatkan di kolam baru, sedangkan kolam asli dirawat dengan piscicide untuk menghilangkan ikan invasif. Setelah dimusnahkan, ikan tersebut dikembalikan ke tambak aslinya. Sementara itu, semua individu dihitung, diidentifikasi, dan ditimbang dari para ahli, memungkinkan estimasi yang tepat untuk kelimpahan dan biomassa ikan.

“Kami kemudian melakukan pengambilan sampel air dan menjalankan analisis genetik untuk menilai keragaman dan kelimpahan urutan genetik ikan, dan membandingkan hasilnya dengan data yang dikumpulkan secara manual. Kami menemukan korelasi positif yang kuat antara jumlah eDNA ikan dan biomassa spesies ikan yang sebenarnya. dan kelimpahan, menunjukkan adanya hubungan yang kuat antara jumlah urutan DNA ikan di air dan kelimpahan ikan yang sebenarnya di lingkungan perairan alami, “lapor Di Muri.

Para ilmuwan berhasil mengidentifikasi semua spesies ikan di kolam: dari yang paling melimpah (yaitu 293 ikan karper dengan berat total 852 kg) hingga yang paling sedikit melimpah (yaitu satu ikan berukuran 0,7 kg), yang menunjukkan keakuratan yang tinggi dari pendekatan non-invasif.

“Selain itu, kami menggunakan metode penangkapan eDNA dan penyimpanan eDNA yang berbeda, dan menemukan bahwa hasil analisis genetik dapat dibandingkan di berbagai pendekatan eDNA. Konsistensi ini memungkinkan fleksibilitas protokol eDNA tertentu, yang sangat penting untuk mempertahankan hasil yang sebanding di seluruh penelitian dan , pada saat yang sama, pilih strategi yang paling sesuai, berdasarkan lokasi yang disurvei atau sumber daya yang tersedia, “Di Muri menjelaskan.

“Peluang menggunakan analisis eDNA untuk menilai secara akurat keanekaragaman dan kelimpahan spesies di lingkungan alami akan mendorong perubahan langkah dalam program pemantauan spesies di masa mendatang, karena alat non-invasif dan fleksibel ini dapat beradaptasi dengan semua lingkungan perairan dan memungkinkan pengawasan keanekaragaman hayati kuantitatif tanpa menghambat kesejahteraan organisme. “

Dipersembahkan Oleh : Lapak Judi

Baca Juga : Data Sidney